{"id":1119,"date":"2012-12-02T12:02:15","date_gmt":"2012-12-02T12:02:15","guid":{"rendered":"http:\/\/quinboigproposit.wordpress.com\/?p=1119"},"modified":"2012-12-02T12:02:15","modified_gmt":"2012-12-02T12:02:15","slug":"col%c2%b7laborar-en-projectes-cientifics-des-de-casa-i-des-dels-centres-educatius","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/2012\/12\/02\/col%c2%b7laborar-en-projectes-cientifics-des-de-casa-i-des-dels-centres-educatius\/","title":{"rendered":"Col\u00b7laborar en projectes cient\u00edfics des de casa… i des dels centres educatius"},"content":{"rendered":"

La Ci\u00e8ncia Ciutadana \u00e9s un nou tipus de ci\u00e8ncia basada en la participaci\u00f3, conscient i volunt\u00e0ria, de milers de ciutadans que generen grans quantitats de dades. Qualsevol persona pot aportar la seua intel\u00b7lig\u00e8ncia o els seus recursos tecnol\u00f2gics per trobar resultats d’utilitat social. No cal tenir coneixements previs ni grans dispositius, es pot fer en qualsevol lloc en qualsevol moment.<\/p>\n

Traducci\u00f3 del primer par\u00e0graf de \u00ab\u00bfQu\u00e9 es la Ciencia Ciudadana?<\/a>\u00bb de la p\u00e0gina web del projecte ibercivis<\/p><\/blockquote>\n

A l’anterior article<\/a> mostr\u00e0vem un joc per a aprendre a plegar prote\u00efnes mitjan\u00e7ant la resoluci\u00f3 de trencaclosques. En aquest, anem a comprovar com es pot participar en una recerca cient\u00edfica cedint la capacitat de l’ordinador mentre el tenim inactiu.<\/p>\n

Hem de descarregar i instal\u00b7lar l’aplicaci\u00f3 BOINC<\/a> de la Universitat de California. Seguidament hem de triar i afegir un projecte del seg\u00fcent llistat<\/a>. Si volem triar projectes que es desenvolupen prop de casa tenim aquests dos:<\/p>\n

1. ibercivis<\/a>, que conta amb la col\u00b7laboraci\u00f3, entre altres, de l’ajuntament de Val\u00e8ncia i de la Universitat Polit\u00e8cnica de Val\u00e8ncia. Des de la p\u00e0gina web d’ibercivis expliquen com podem unir-nos a aquest projecte de computaci\u00f3 volunt\u00e0ria en nom\u00e9s 5 passos<\/a>.<\/p>\n

Ibercivis engloba un nombre creixent de projectes de recerca amb participaci\u00f3 de centres p\u00fablics espanyols, com per exemple \u00abDOCKING: a la recerca de f\u00e0rmacs contra el c\u00e0ncer\u00bb.<\/p>\n

El Docking \u00e9s un m\u00e8tode modern de recerca sistem\u00e0tica de noves subst\u00e0ncies amb efectes terap\u00e8utics basat en la simulaci\u00f3 per ordinador. La Unitat de Bioinform\u00e0tica del Centre de Biologia Molecular Severo Ochoa (CSIC-UAM) porta diversos anys desenvolupant una plataforma inform\u00e0tica que permeta simular autom\u00e0ticament interaccions de prote\u00efnes i petites mol\u00e8cules. La seua finalitat \u00e9s buscar f\u00e0rmacs per al tractament de malalties de gran incid\u00e8ncia en la poblaci\u00f3, com el c\u00e0ncer.<\/p><\/blockquote>\n

2. GPUGRID.net<\/a>. \u00c9s una infraestructura de computaci\u00f3 distribu\u00efda dedicada a la investigaci\u00f3 biom\u00e8dica. Gr\u00e0cies a la contribuci\u00f3 dels voluntaris, els cient\u00edfics GPUGRID poden realitzar simulacions moleculars per entendre la funci\u00f3 de les prote\u00efnes en la salut i la malaltia.<\/p>\n

En el cas del meu ordinador, quan afegisc el projecte GPUGRID.net a l’aplicaci\u00f3 BOINC apareix aquest missatge: \u00abAn NVIDIA GPU is required to run tasks for this project<\/em>\u00ab. Que hi farem, no pense canviar la targeta gr\u00e0fica de la m\u00e0quina per a participar en el c\u00e0lcul de simulacions moleculars, aix\u00ed que em conforme amb la participaci\u00f3 en la plataforma de computaci\u00f3 ciutadana ibercivis.<\/p>\n

Un exemple. Experiments<\/strong> d’investigaci\u00f3 del c\u00e0ncer<\/a>: Simulacions moleculars del proc\u00e9s d’uni\u00f3 SH2 i fosfop\u00e8tid<\/strong><\/p>\n

El SH2 \u00e9s un domini de prote\u00efna implicat en les interaccions prote\u00efna-prote\u00efna. A la web del projecte GPUGRID.net podem trobar un v\u00eddeo que mostra una simulaci\u00f3 de la uni\u00f3 del fosfop\u00e8ptid pYEEI al domini SH2. La superf\u00edcie de les prote\u00efnes i els \u00e0toms del lligand tenen un codi de colors per ressaltar la flexibilitat local. A mesura que el p\u00e8ptid s’uneix en la seua conformaci\u00f3 nativa perd flexibilitat (color blau), el mateix li passa a la prote\u00efna. Un segon de pel\u00b7l\u00edcula correspon a 2 nanosegons de temps real.<\/p>\n

[youtube=http:\/\/www.youtube.com\/watch?v=V0Z52u8h2es]\n

(Al v\u00eddeo li falta un poc de m\u00fasica, per\u00f2 est\u00e0 b\u00e9)<\/p>\n

Participaci\u00f3 de centres educatius<\/strong><\/p>\n

Si tenim en compte el temps d’inactivitat d’alguns ordinadors dels centres educatius, no hauria d’haver cap problema en cedir eixe temps a la recerca cient\u00edfica. De fet, en ibercivis participen equips<\/a> de centres educatius. L’\u00fanic que s’hauria de fer es presentar el projecte de participaci\u00f3 al Consell Escolar del Centre, que aquest aprovara l’adhesi\u00f3 al projecte i a continuaci\u00f3 la feina de mec\u00e0nic: instal\u00b7lar l’aplicaci\u00f3 BOINC, afegir el projecte de computaci\u00f3 volunt\u00e0ria, registrar el centre educatiu en el projecte i configurar les prefer\u00e8ncies. Tot el treball de mec\u00e0nica s’ha de repetir amb els diverses m\u00e0quines que volem que col\u00b7laboren amb la recerca cient\u00edfica.<\/p>\n

\"Captura<\/a>
Captura de pantalla de BOINC fent c\u00e0lculs per a ibercivis en LliureX Nemo<\/figcaption><\/figure>\n

Instal\u00b7laci\u00f3 de BOINC en LliureX Nemo<\/strong><\/p>\n

Per a instal\u00b7lar BOINC en LliureX 12.06 hem d’activar els dip\u00f2sits d’Ubuntu i instal\u00b7lar els paquets \u00abboinc-client\u00bb i \u00abboinc-manager\u00bb. Despr\u00e9s de la instal\u00b7laci\u00f3 hem de desactivar els dip\u00f2sits d’Ubuntu<\/strong> per a evitar actualitzacions conflictives. (Font: Installing BOINC on Ubuntu<\/a>)<\/p>\n

Trobarem l’aplicaci\u00f3 \u00abBOINC Manager\u00bb en Aplicacions > Ferramentes de sistema.<\/p>\n

\"Captura<\/a>
Captura del men\u00fa Aplicacions de LliureX Nemo<\/figcaption><\/figure>\n

Si hem instal\u00b7lat BOINC en un equip de la sala de professorat i volem que s’inicie cada vegada que engeguem l’ordinador:<\/p>\n

– Afegim el llan\u00e7ador \u00abBOINC Manager\u00bb a l’escriptori.<\/del><\/p>\n

– Anem a Sistema > Prefer\u00e8ncies > Sessions<\/p>\n

-En la finestra \u00abAfig el programa d’inici\u00bb posem com a Nom<\/strong> \u00abBoinc Manager\u00bb, fem clic al bot\u00f3 <<Navega>> per a afegir l’aplicaci\u00f3 \u00abboinc-manager.desktop\u00bb que es troba a la carpeta Desktop<\/strong> de l’usuari.<\/del><\/p>\n

Actualitzat: En el camp<\/strong> Orde posem \u00ab\/usr\/bin\/boincmgr\u00bb<\/p>\n

Tamb\u00e9 podem posar un Comentari<\/strong>.<\/p>\n

\"<\/a>
Captura de la finestra \u00abAfig el programa d’inici\u00bb en LliureX Nemo<\/figcaption><\/figure>\n

Material Did\u00e0ctic<\/strong><\/p>\n

Per finalitzar, a la web d’ibercivis podem trobar material did\u00e0ctic<\/a> sobre els diversos projectes de recerca en que tenen treballant als ordinadors personals.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

La Ci\u00e8ncia Ciutadana \u00e9s un nou tipus de ci\u00e8ncia basada en la participaci\u00f3, conscient i volunt\u00e0ria, de milers de ciutadans que generen grans quantitats de dades. Qualsevol persona pot aportar la seua intel\u00b7lig\u00e8ncia o els seus recursos tecnol\u00f2gics per trobar resultats d’utilitat social. No cal tenir coneixements previs ni grans dispositius, es pot fer en … Llegiu m\u00e9s<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":10,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"activitypub_content_warning":"","activitypub_content_visibility":"","activitypub_max_image_attachments":4,"activitypub_interaction_policy_quote":"anyone","activitypub_status":"","footnotes":""},"categories":[3,8,16,29],"tags":[49,53,59,65,74],"class_list":["post-1119","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-aplicacions-didactiques","category-ensenyament","category-lliurex","category-programari-lliure","tag-aplicacions-didactiques","tag-ciencia","tag-ensenyament","tag-lliurex","tag-programari"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1119","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/users\/10"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1119"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/1119\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1119"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=1119"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/edutictac.es\/blog\/datunie\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=1119"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}